El desarrollo social contemporáneo exige la presencia de médicos especialistas bien formados, para garantizar la calidad de los servicios de salud. Este proceso formativo se desarrolla en el contexto de la integración docente-asistencial-investigativa. La base del sistema de salud en Cuba se sustenta en la Atención Primaria de Salud, con un rol importante en el perfeccionamiento y actualización de los profesionales que laboran en este nivel de atención. Se propone un método indagativo e interpretativo de alternativas innovadoras para la solución de problemas profesionales en la atención primaria de salud para la formación de la competencia investigativa en la aplicación del método científico a través del método clínico-epidemiológico en los residentes de Medicina General Integral. Fueron empleados los métodos de revisión de documentos y el análisis y síntesis. Se concluye que el método  contribuye al perfeccionamiento del desempeño laboral investigativo del especialista de Medicina General Integral en la atención primaria de salud, con el consiguiente incremento de la calidad de la atención médica y la satisfacción de la población.